ຊຸດການສູນເສຍ TIANSeq rRNA (H/M/R)

ການສູນເສຍ ribosomal RNA ຢ່າງໄວແລະມີປະສິດທິພາບ, ເຊິ່ງເພີ່ມອັດຕາສ່ວນຂອງຂໍ້ມູນການຈັດ ລຳ ດັບທີ່ມີປະສິດທິພາບ.

TIANSeq rRNA Depletion Kit (H/M/R) ຖືກອອກແບບມາເປັນພິເສດເພື່ອເອົາ RNA ribosomal ອອກຈາກ RNA ຂອງມະນຸດ, ໜູ ແລະ ໜູ, ໃນຂະນະທີ່ຮັກສາ RNA messenger (mRNA) ແລະ RNA ອື່ນ-ທີ່ບໍ່ໄດ້ເຂົ້າລະຫັດ. ຊຸດດັ່ງກ່າວມີຜົນກະທົບຕໍ່ການກໍາຈັດ rRNA ທີ່ດີທັງ RNA ທັງcompleteົດທີ່ສົມບູນແລະບາງສ່ວນເຊື່ອມໂຊມ (ເຊັ່ນ: FFPE RNA). ຕົວຢ່າງ RNA ທີ່ເອົາອອກຈາກ rRNA ສາມາດໃຊ້ສໍາລັບການກະກຽມຫ້ອງສະຸດ RNA NGS ທີ່ບໍ່ມີລະຫັດ.

ແມວ. ບໍ່ ຂະ ໜາດ ບັນຈຸ
4992363 6 rxn
4992363 24 rxn
4992391 96 rxn

ລາຍລະອຽດຜະລິດຕະພັນ

ຂະບວນການເຮັດວຽກ

ຕົວຢ່າງການທົດລອງ

ຄຳ ຖາມທີ່ຖືກຖາມເລື້ອຍ

ປ້າຍຜະລິດຕະພັນ

ຄຸນ​ລັກ​ສະ​ນະ

range ລະດັບຕົວຢ່າງທີ່ກວ້າງຂວາງ: ເSuitableາະສົມສໍາລັບການສູນເສຍ rRNA ໃນຕົວຢ່າງທີ່ມີຄຸນນະພາບສູງ (ສົມບູນ) ແລະຊຸດໂຊມບາງສ່ວນ (ຕົວຢ່າງ FFPE).
removal ການກໍາຈັດ rRNA ທີ່ມີປະສິດທິພາບ: 95-99.9% ຂອງມະນຸດ/ໜູ/ໜູ rRNA ຖືກກໍາຈັດຢ່າງມີປະສິດທິພາບ.
data ຂໍ້ມູນທີ່ສົມບູນແບບ: ຂໍ້ມູນ mRNA ບໍ່ຄົບຖ້ວນແລະຂໍ້ມູນ RNA ທີ່ບໍ່ມີການເຂົ້າລະຫັດຖືກເກັບຮັກສາໄວ້, ເຮັດໃຫ້ຂໍ້ມູນການຖອດຂໍ້ມູນໄດ້ມີຄວາມສົມບູນກວ່າ.
evaluation ການປະເມີນຜົນຢ່າງໄວ: ຕົວປະຖົມທີ່ໄດ້ສະ ໜອງ ໃຫ້ໃນຊຸດສາມາດປະເມີນຜົນການກໍາຈັດ rRNA ໄດ້ຢ່າງໄວ.

ສະເປັກ

ປະເພດ: ການປັບປຸງ RNA ກ່ອນການກະກຽມຫ້ອງສະຸດ RNA
ຕົວຢ່າງ: RNA ທັງົດ
ເປົ້າ​ຫມາຍ: mRNA ແລະ RNA ທີ່ບໍ່ມີການເຂົ້າລະຫັດ
ປະລິມານເລີ່ມຕົ້ນ: 100 ng-1 μg
ເວລາປະຕິບັດງານ: 2 ຊົ່ວໂມງ
ແອັບພລິເຄຊັນທາງລຸ່ມ: ການກະກຽມຫ້ອງສະຸດ RNA

ຜະລິດຕະພັນທັງຫມົດສາມາດໄດ້ຮັບການປັບແຕ່ງສໍາລັບ ODM/OEM. ສໍາລັບລາຍລະອຽດ,ກະລຸນາຄລິກບໍລິການລູກຄ້າ (ODM/OEM)


  • ທີ່ຜ່ານມາ:
  • ຕໍ່ໄປ:

  • product_certificate04 product_certificate01 product_certificate03 product_certificate02
    ×

    Workflow

    Experimental ຜົນໄດ້ຮັບ Agilent 2100 ສະແດງໃຫ້ເຫັນວ່າການກໍາຈັດ rRNA ແມ່ນສໍາເລັດສໍາລັບຄຸນນະພາບສູງ (ຄືເດີມ) ແລະຕົວຢ່າງຊຸດໂຊມບາງສ່ວນ.
    Experimental ຜົນການຈັດ ລຳ ດັບຂອງ NGS ສະແດງໃຫ້ເຫັນວ່າ rRNA ຖືກລຶບອອກcompletelyົດ: ຜົນການຈັດ ລຳ ດັບຂອງ RNA ທັງliverົດຂອງຕັບຫນູສະແດງໃຫ້ເຫັນວ່າກ່ອນທີ່ຈະໃຊ້ຊຸດເພື່ອເອົາ rRNA ອອກ, ການອ່ານຂອງກຸ່ມຄວບຄຸມກວມເອົາຫຼາຍກວ່າ 85% ຂອງການອ່ານແຜນທີ່ທັງ,ົດ, ໃນຂະນະທີ່ການອ່ານຂອງ rRNA ຫຼັງ TIANSeq rRNA Depletion Kit (H/M/R) ກວມເອົາ ໜ້ອຍ ກວ່າ 0.2%. ຜົນການຈັດລໍາດັບຂອງ RNA ທັງliverົດຂອງຕັບຫນູສະແດງໃຫ້ເຫັນວ່າກ່ອນການນໍາໃຊ້ຊຸດເພື່ອເອົາ rRNA ອອກ, ກຸ່ມການຄວບຄຸມໄດ້ອ່ານຫຼາຍກວ່າ 85. % ຂອງການອ່ານແຜນທີ່ທັງ,ົດ, ໃນຂະນະທີ່ການອ່ານ rRNA ຫຼັງຈາກການ ກຳ ຈັດ TIANSeq rRNA ຊຸດສະສົມ (H/M/R) ກວມເອົາ ໜ້ອຍ ກວ່າ 0.2%.
    ຖາມ: ການແຜ່ກະຈາຍທົ່ວໄປຂອງຂະ ໜາດ ຊິ້ນສ່ວນຢູ່ໃນຫ້ອງສະNGຸດ NGS ແມ່ນຫຍັງ?

    ປັດຈຸບັນ, ເຕັກໂນໂລຍີການຈັດລໍາດັບຄວາມໄວສູງສ່ວນໃຫຍ່ແມ່ນອີງໃສ່ເທັກໂນໂລຍີການຮຽງລໍາດັບລຸ້ນຕໍ່ໄປ. ເນື່ອງຈາກວ່າຄວາມຍາວການອ່ານຂອງເທັກໂນໂລຍີການຮຽງລໍາດັບລຸ້ນຕໍ່ໄປແມ່ນມີຈໍາກັດ, ພວກເຮົາຕ້ອງແຍກລໍາດັບຄວາມຍາວທັງintoົດອອກເປັນຫ້ອງສະfragຸດຊິ້ນສ່ວນນ້ອຍ to ເພື່ອລໍາດັບ. ອີງຕາມຄວາມຕ້ອງການຂອງການທົດລອງການຈັດລໍາດັບທີ່ແຕກຕ່າງກັນ, ໂດຍປົກກະຕິແລ້ວພວກເຮົາເລືອກການຈັດລໍາດັບຊັ້ນດຽວຫຼືສິ້ນສຸດສອງເທື່ອ. ປະຈຸບັນຊິ້ນສ່ວນ DNA ຂອງຫ້ອງສະsequຸດຈັດ ລຳ ດັບລຸ້ນຕໍ່ໄປໂດຍທົ່ວໄປແມ່ນແຈກຢາຍຢູ່ໃນລະດັບ 200-800 bp.

    excel
    ຖາມ: ຄວາມເຂັ້ມຂົ້ນຂອງ DNA ຂອງຫ້ອງສະconstructedຸດທີ່ສ້າງຂຶ້ນແມ່ນຕໍ່າ.

    ກ) DNA ບໍ່ມີຄຸນນະພາບແລະມີສານຍັບຍັ້ງ. ໃຊ້ຕົວຢ່າງ DNA ທີ່ມີຄຸນນະພາບສູງເພື່ອຫຼີກເວັ້ນການສະກັດກັ້ນການເຄື່ອນໄຫວຂອງເອນໄຊ.

    ຂ) ຈໍານວນຕົວຢ່າງ DNA ແມ່ນບໍ່ພຽງພໍເມື່ອນໍາໃຊ້ວິທີການທີ່ບໍ່ມີ PCR ເພື່ອສ້າງຫ້ອງສະDNAຸດ DNA. ເມື່ອການປ້ອນຂໍ້ມູນ DNA ທີ່ກະແຈກກະຈາຍເກີນ 50 ng, ຂະບວນການເຮັດວຽກທີ່ບໍ່ມີ PCR ສາມາດເລືອກໄດ້ໃນລະຫວ່າງຂັ້ນຕອນການກໍ່ສ້າງຫ້ອງສະຸດ. ຖ້າຈໍານວນສໍາເນົາຂອງຫ້ອງສະຸດຕໍ່າເກີນໄປທີ່ຈະຈັດລໍາດັບໄດ້ໂດຍກົງ, ຫ້ອງສະDNAຸດ DNA ສາມາດຂະຫຍາຍອອກໄດ້ໂດຍ PCR ຫຼັງຈາກການຕິດຕໍ່ອະແດັບເຕີ.

    c) ການປົນເປື້ອນ RNA ນໍາໄປສູ່ການກວດສອບປະລິມານ DNA ເບື້ອງຕົ້ນທີ່ບໍ່ຖືກຕ້ອງການປົນເປື້ອນ RNA ອາດຈະມີຢູ່ໃນຂັ້ນຕອນການກັ່ນຕອງ DNA ພັນທຸກໍາ, ເຊິ່ງອາດຈະເຮັດໃຫ້ປະລິມານ DNA ບໍ່ຖືກຕ້ອງແລະການໂຫຼດ DNA ບໍ່ພຽງພໍໃນລະຫວ່າງການສ້າງຫ້ອງສະຸດ. RNA ສາມາດເອົາອອກໄດ້ໂດຍການປິ່ນປົວດ້ວຍ RNase.

    ຖາມ: ຫ້ອງສະDNAຸດ DNA ໄດ້ສະແດງໃຫ້ເຫັນແຖບທີ່ຜິດປົກກະຕິໃນການວິເຄາະ electrophoresis.

    A-1

    ກ) ຊິ້ນສ່ວນຂະ ໜາດ ນ້ອຍ (60 bp-120 bp) ປະກົດວ່າຊິ້ນສ່ວນຂະ ໜາດ ນ້ອຍໂດຍປົກກະຕິແລ້ວເປັນຊິ້ນສ່ວນຂອງອະແດັບເຕີຫຼື dimers ທີ່ສ້າງຂຶ້ນໂດຍຕົວແປງ. ການເຮັດໃຫ້ບໍລິສຸດດ້ວຍລູກປັດສະນະແມ່ເຫຼັກຂອງ Agencourt AMPure XP ສາມາດເອົາຊິ້ນສ່ວນເຄື່ອງປັບເຫຼົ່ານີ້ອອກໄດ້ຢ່າງມີປະສິດທິພາບແລະຮັບປະກັນຄຸນນະພາບການຈັດລໍາດັບ.

    ຂ. ຖ້າຊິ້ນສ່ວນ DNA ເພີ່ມຂຶ້ນຫຼາຍກ່ວາ 120 bp ຫຼັງຈາກການຕໍ່ສາຍອະແດບເຕີ, ມັນອາດຈະເກີດຈາກການຂະຫຍາຍຊິ້ນສ່ວນຜິດປົກກະຕິຂອງການຂະຫຍາຍ PCR ຫຼາຍເກີນໄປ. ການຫຼຸດຜ່ອນຈໍານວນຂອງຮອບວຽນ PCR ສາມາດປ້ອງກັນສະຖານະການໄດ້.

    c) ຂະ ໜາດ ຜິດປົກກະຕິຂອງຊິ້ນສ່ວນ DNA ຂອງຫ້ອງສະafterຸດຫຼັງຈາກການຕໍ່ສາຍໄຟຄວາມຍາວຂອງຕົວດັດແປງໃນຊຸດນີ້ແມ່ນ 60 bp. ເມື່ອສອງສົ້ນຂອງຊິ້ນສ່ວນຖືກເຊື່ອມເຂົ້າກັບອະແດັບເຕີ, ຄວາມຍາວຈະເພີ່ມຂຶ້ນພຽງແຕ່ 120 bp. ເມື່ອໃຊ້ອະແດັບເຕີອື່ນທີ່ບໍ່ໄດ້ສະ ໜອງ ໃຫ້ໂດຍຊຸດນີ້, ກະລຸນາຕິດຕໍ່ຫາຜູ້ສະ ໜອງ ເພື່ອໃຫ້ຂໍ້ມູນທີ່ກ່ຽວຂ້ອງເຊັ່ນ: ຄວາມຍາວຂອງອະແດັບເຕີ. ກະລຸນາຮັບປະກັນວ່າຂັ້ນຕອນການເຮັດວຽກແລະການດໍາເນີນການທົດລອງປະຕິບັດຕາມຂັ້ນຕອນທີ່ໄດ້ອະທິບາຍໄວ້ຢູ່ໃນຄູ່ມື.

    d) ຂະ ໜາດ ຊິ້ນສ່ວນ DNA ຜິດປົກກະຕິກ່ອນການຕໍ່ສາຍສາກເຫດຜົນຂອງບັນຫານີ້ອາດເກີດຈາກສະພາບການປະຕິກິລິຍາຜິດພາດໃນລະຫວ່າງການກະຈາຍ DNA. ເວລາຕິກິຣິຍາທີ່ແຕກຕ່າງກັນຄວນຖືກນໍາໃຊ້ສໍາລັບການປ້ອນເຂົ້າ DNA ທີ່ແຕກຕ່າງກັນ. ຖ້າການປ້ອນ DNA ຫຼາຍກ່ວາ 10 ng, ພວກເຮົາແນະນໍາໃຫ້ເລືອກເວລາປະຕິກິລິຍາຂອງ 12 ນາທີເປັນເວລາເລີ່ມຕົ້ນສໍາລັບການເພີ່ມປະສິດທິພາບ, ແລະຂະ ໜາດ ຊິ້ນສ່ວນທີ່ຜະລິດອອກມາໃນເວລານີ້ສ່ວນໃຫຍ່ແມ່ນຢູ່ໃນຊ່ວງ 300-500 bp. ຜູ້ໃຊ້ສາມາດເພີ່ມຫຼືຫຼຸດຄວາມຍາວຂອງຊິ້ນ DNA ເປັນເວລາ 2-4 ນາທີຕາມຄວາມຕ້ອງການຂອງເຂົາເຈົ້າເອງເພື່ອເພີ່ມປະສິດທິພາບຂອງຊິ້ນ DNA ດ້ວຍຂະ ໜາດ ທີ່ຕ້ອງການ.

    ກ -2

    ກ) ເວລາການກະຈາຍບໍ່ໄດ້ຖືກປັບໃຫ້ເIfາະສົມຖ້າ DNA ທີ່ກະແຈກກະຈາຍມີຂະ ໜາດ ນ້ອຍເກີນໄປຫຼືໃຫຍ່ເກີນໄປ, ກະລຸນາອ້າງອີງເຖິງຂໍ້ແນະນໍາສໍາລັບການເລືອກເວລາການແບ່ງສ່ວນທີ່ໃຫ້ໄວ້ໃນຄໍາແນະນໍາເພື່ອກໍານົດເວລາຕິກິຣິຍາ, ແລະໃຊ້ຈຸດເວລານີ້ເປັນຕົວຄວບຄຸມ, ນອກຈາກນັ້ນຕັ້ງຄ່າ ລະບົບປະຕິກິລິຍາທີ່ຈະຍືດຍາວຫຼືຫຼຸດອອກ 3 ນາທີເພື່ອເຮັດໃຫ້ມີການປັບຕົວທີ່ຖືກຕ້ອງຫຼາຍຂຶ້ນກ່ຽວກັບເວລາການກະຈາຍ.

    ກ -3

    ການກະຈາຍຂະ ໜາດ ຜິດປົກກະຕິຂອງ DNA ຫຼັງຈາກການປິ່ນປົວດ້ວຍການແບ່ງຕົວ

    ກ. ລະລາຍ 5 × Fragmentation Enzyme Mix ນ້ ຳ ຢາກ້ອນ. ເມື່ອລະລາຍແລ້ວ, ໃຫ້ປະສົມນໍ້າຢາໃສ່ສະເlyີກັນໂດຍການຖອດລຸ່ມຂອງທໍ່ຄ່ອຍ gently. ບໍ່ vortex reagent ໄດ້!

    b) ຕົວຢ່າງການປ້ອນ DNA ປະກອບດ້ວຍ EDTA ຫຼືມົນລະພິດອື່ນ De ການເຮັດໃຫ້ທາດໄອອອນເກືອandົດແລະຕົວແທນ chelating ໃນຂັ້ນຕອນການກັ່ນຕອງ DNA ແມ່ນມີຄວາມສໍາຄັນເປັນພິເສດຕໍ່ກັບຜົນສໍາເລັດຂອງການທົດລອງ. ຖ້າ DNA ຖືກລະລາຍໃນ 1 × TE, ໃຊ້ວິທີການທີ່ໃຫ້ໄວ້ໃນຄໍາແນະນໍາເພື່ອປະຕິບັດການແຍກຕົວ. ຖ້າຄວາມເຂັ້ມຂົ້ນຂອງ EDTA ຢູ່ໃນການແກ້ໄຂແມ່ນບໍ່ແນ່ນອນ, ຂໍແນະນໍາໃຫ້ເຮັດຄວາມສະອາດ DNA ແລະເຮັດໃຫ້ລະລາຍໃນນໍ້າ deionized ສໍາລັບປະຕິກິລິຍາຕໍ່ມາ.

    c) ປະລິມານ DNA ເບື້ອງຕົ້ນທີ່ບໍ່ຖືກຕ້ອງຂະ ໜາດ ຂອງ DNA ທີ່ກະແຈກກະຈາຍແມ່ນກ່ຽວຂ້ອງຢ່າງໃກ້ຊິດກັບປະລິມານການປ້ອນເຂົ້າ DNA. ກ່ອນການປິ່ນປົວການກະແຈກກະຈາຍ, ປະລິມານທີ່ຖືກຕ້ອງຂອງ DNA ໂດຍໃຊ້ Qubit, Picogreen ແລະວິທີການອື່ນ other ແມ່ນເປັນສິ່ງຈໍາເປັນເພື່ອກໍານົດຈໍານວນທີ່ແນ່ນອນຂອງ DNA ໃນລະບົບປະຕິກິລິຍາ.

     d) ການກະກຽມລະບົບປະຕິກິລິຍາບໍ່ໄດ້ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາການກະກຽມລະບົບປະຕິກິລິຍາທີ່ກະແຈກກະຈາຍຕ້ອງດໍາເນີນຢູ່ເທິງນໍ້າກ້ອນຢ່າງເຂັ້ມງວດຕາມຄໍາແນະນໍາ. ເພື່ອຮັບປະກັນຜົນກະທົບທີ່ດີທີ່ສຸດ, ສ່ວນປະກອບຂອງປະຕິກິລິຍາທັງshouldົດຄວນວາງໃສ່ເທິງນໍ້າກ້ອນແລະການກະກຽມລະບົບປະຕິກິລິຍາຄວນດໍາເນີນຫຼັງຈາກຄວາມເຢັນສົມບູນ. ຫຼັງຈາກການກະກຽມສໍາເລັດແລ້ວ, ກະລຸນາຕີຫຼື pipet ປະສົມຢ່າງລະອຽດ. ບໍ່ vortex!

    ຖາມ: ບັນທຶກທີ່ ສຳ ຄັນ ສຳ ລັບຊຸດຫ້ອງສະDNAຸດ DNA ຂອງ TIANSeq DirectFast (Illumina) (4992259/4992260)

    1. ວິທີການປະສົມທີ່ບໍ່ຖືກຕ້ອງ (vortex, ການສັ່ນສະເທືອນທີ່ຮຸນແຮງ, ແລະອື່ນ)) ຈະເຮັດໃຫ້ເກີດການກະຈາຍຜິດປົກກະຕິຂອງຊິ້ນສ່ວນຂອງຫ້ອງສະຸດ (ດັ່ງທີ່ສະແດງຢູ່ໃນຮູບຕໍ່ໄປນີ້), ດັ່ງນັ້ນຈຶ່ງສົ່ງຜົນກະທົບຕໍ່ຄຸນນະພາບຂອງຫ້ອງສະຸດ. ສະນັ້ນ, ເວລາກະກຽມວິທີແກ້ໄຂປະສົມ Fragmentation Mix, ກະລຸນາຄ່ອຍ ​​pip ປີ້ນຂຶ້ນແລະລົງເພື່ອປະສົມ, ຫຼືໃຊ້ປາຍນິ້ວມືປັດແລະປະສົມໃຫ້ເທົ່າກັນ. ຈົ່ງລະມັດລະວັງບໍ່ໃຫ້ປະສົມກັບ vortex.

    excel

    2. DNA ທີ່ມີຄວາມບໍລິສຸດສູງຕ້ອງຖືກ ນຳ ໃຊ້ເຂົ້າໃນການກໍ່ສ້າງຫ້ອງສະຸດ

    integrity ຄວາມສົມບູນຂອງ DNA ດີ: ແຖບ electrophoresis ມີຫຼາຍກວ່າ 30 kb, ໂດຍບໍ່ມີການຫາງ

    ■ OD260/230:> 1.5

    ■ OD260/280: 1.7-1.9

    3. ປະລິມານການປ້ອນ DNA ຕ້ອງຖືກຕ້ອງມັນໄດ້ຖືກແນະນໍາໃຫ້ນໍາໃຊ້ວິທີການ Qubit ແລະ PicoGreen ເພື່ອກໍານົດປະລິມານ DNA, ແທນທີ່ຈະແມ່ນ Nanodrop.

    4. ເນື້ອໃນຂອງ EDTA ຢູ່ໃນວິທີແກ້ໄຂ DNA ຕ້ອງຖືກກໍານົດວ່າ EDTA ມີອິດທິພົນອັນໃຫຍ່ຫຼວງຕໍ່ກັບປະຕິກິລິຍາການແບ່ງສ່ວນ. ຖ້າເນື້ອໃນຂອງ EDTA ສູງ, ການກວດ DNA ຕ້ອງເຮັດໃຫ້ສະອາດກ່ອນການກວດຄັ້ງຕໍ່ໄປ.

    5. ວິທີແກ້ໄຂປະຕິກິລິຍາການກະຈາຍຄວາມຮ້ອນຕ້ອງໄດ້ກະກຽມໄວ້ເທິງນ້ ຳ ກ້ອນຂະບວນການກະຈາຍຄວາມອ່ອນໄຫວຕໍ່ກັບອຸນຫະພູມແລະເວລາປະຕິກິລິຍາ (ໂດຍສະເພາະຫຼັງຈາກເພີ່ມເຄື່ອງເພີ່ມເຂົ້າໄປ). ເພື່ອຮັບປະກັນຄວາມຖືກຕ້ອງຂອງເວລາປະຕິກິລິຍາ, ກະລຸນາກຽມລະບົບປະຕິກິລິຍາໃສ່ນໍ້າກ້ອນ.

    6. ເວລາປະຕິກິລິຍາຂອງການແບ່ງສ່ວນຈະຕ້ອງຖືກຕ້ອງເວລາປະຕິກິລິຍາຂອງຂັ້ນຕອນການແບ່ງສ່ວນຈະມີຜົນກະທົບໂດຍກົງຕໍ່ຂະ ໜາດ ຂອງຜະລິດຕະພັນທີ່ເປັນຊິ້ນສ່ວນ, ສະນັ້ນສົ່ງຜົນກະທົບຕໍ່ການກະຈາຍຂະ ໜາດ ຂອງຊິ້ນສ່ວນ DNA ໃນຫ້ອງສະຸດ.

    ຖາມ: ບັນທຶກ ສຳ ຄັນ ສຳ ລັບຊຸດຫ້ອງສະTIຸດ RNA ໄວຂອງ TIANSeq (Illumina) (4992375/4992376)

    1. ຕົວຢ່າງປະເພດໃດທີ່ສາມາດໃຊ້ໄດ້ກັບຊຸດນີ້?

    ປະເພດຕົວຢ່າງທີ່ໃຊ້ໄດ້ຂອງຊຸດນີ້ສາມາດເປັນ RNA ທັງorົດຫຼື mRNA ທີ່ບໍລິສຸດດ້ວຍຄວາມສົມບູນຂອງ RNA ດີ. ຖ້າ RNA ທັງisົດຖືກໃຊ້ເພື່ອສ້າງຫ້ອງສະຸດ, ແນະນໍາໃຫ້ໃຊ້ຊຸດການສູນເສຍ rRNA (Cat#4992363/4992364/4992391) ເພື່ອເອົາ rRNA ອອກກ່ອນ.

    2. ຕົວຢ່າງ FFPE ສາມາດນໍາໃຊ້ເພື່ອສ້າງຫ້ອງສະwithຸດດ້ວຍຊຸດນີ້ໄດ້ບໍ?

    mRNA ໃນຕົວຢ່າງ FFPE ຈະຖືກເຊື່ອມໂຊມລົງໃນລະດັບໃດ ໜຶ່ງ, ດ້ວຍຄວາມສົມບູນທີ່ບໍ່ດີ. ເມື່ອໃຊ້ຊຸດນີ້ສໍາລັບການກໍ່ສ້າງຫ້ອງສະຸດ, ແນະນໍາໃຫ້ໃຊ້ເວລາການກະຈາຍໃຫ້ດີທີ່ສຸດ (ຫຍໍ້ເວລາການກະຈາຍຫຼືບໍ່ປະຕິບັດການແບ່ງສ່ວນ).

    3. ການນໍາໃຊ້ຂັ້ນຕອນການຄັດເລືອກຂະ ໜາດ ທີ່ໃຫ້ໄວ້ຢູ່ໃນຄູ່ມືຜະລິດຕະພັນ, ອັນໃດທີ່ອາດຈະເຮັດໃຫ້ພາກສ່ວນທີ່ໃສ່ແລ້ວປະກົດວ່າມີການບ່ຽງເບນເລັກນ້ອຍ?

    ການຄັດເລືອກຂະ ໜາດ ຈະຕ້ອງດໍາເນີນຢ່າງເຂັ້ມງວດຕາມຂັ້ນຕອນການເລືອກຂະ ໜາດ ຢູ່ໃນຄູ່ມືຜະລິດຕະພັນນີ້. ຖ້າມີການບ່ຽງເບນ, ເຫດຜົນອາດຈະແມ່ນວ່າລູກປັດສະນະແມ່ເຫຼັກບໍ່ສົມດຸນກັບອຸນຫະພູມຫ້ອງຫຼືບໍ່ຖືກປະສົມເຂົ້າກັນຢ່າງເຕັມທີ່, ທໍ່ສົ່ງທໍ່ບໍ່ຖືກຕ້ອງຫຼືແຫຼວຍັງຄົງຢູ່ໃນສ່ວນປາຍ. ມັນໄດ້ຖືກແນະນໍາໃຫ້ໃຊ້ຄໍາແນະນໍາທີ່ມີການດູດຊຶມຕໍ່າສໍາລັບການທົດລອງ.

    4. ການເລືອກຕົວດັດແປງໃນການກໍ່ສ້າງຫ້ອງສະຸດ

    ຊຸດການກໍ່ສ້າງຫ້ອງສະdoesຸດບໍ່ມີຕົວປະສົມນໍ້າຢາ, ແລະແນະ ນຳ ໃຫ້ໃຊ້ຊຸດນີ້ຮ່ວມກັບ TIANSeq ດັດຊະນີດັດຊະນີດ່ຽວ (Illumina) (4992641/4992642/4992378).

    5. QC ຂອງຫ້ອງສະຸດ

    ການກວດຫາປະລິມານໃນຫ້ອງສະຸດ: Qubit ແລະ qPCR ຖືກໃຊ້ເພື່ອ ກຳ ນົດຄວາມເຂັ້ມຂຸ້ນຂອງມະຫາຊົນແລະຄວາມເຂັ້ມຂຸ້ນຂອງ molar ຂອງຫ້ອງສະຸດຕາມ ລຳ ດັບ. ການດໍາເນີນງານແມ່ນສອດຄ່ອງກັບຄູ່ມືຜະລິດຕະພັນຢ່າງເຂັ້ມງວດ. ໂດຍທົ່ວໄປແລ້ວຄວາມເຂັ້ມຂົ້ນຂອງຫ້ອງສະຸດຈະຕອບສະ ໜອງ ໄດ້ຄວາມຮຽກຮ້ອງຕ້ອງການຂອງລໍາດັບ NGS. ການກວດຫາລະດັບການແຈກຢາຍຫ້ອງສະຸດ: ການໃຊ້ Agilent 2100 Bioanalyzer ເພື່ອກວດຫາຂອບເຂດການແຈກຢາຍຫ້ອງສະຸດ.

    6. ການເລືອກcycleາຍເລກຮອບວຽນການຂະຫຍາຍ

    ອີງຕາມຄໍາແນະນໍາ, ຈໍານວນຂອງຮອບວຽນ PCR ແມ່ນ 6-12, ແລະຈໍານວນຂອງຮອບວຽນ PCR ທີ່ຈໍາເປັນຄວນໄດ້ຮັບການຄັດເລືອກອີງຕາມການປ້ອນຕົວຢ່າງ. ຢູ່ໃນຫ້ອງສະຸດທີ່ໃຫ້ຜົນຜະລິດສູງ, ການຂະຫຍາຍຕົວຫຼາຍກວ່າປົກກະຕິເກີດຂື້ນໃນລະດັບແຕກຕ່າງກັນ, ເຊິ່ງສະແດງອອກໂດຍຈຸດສູງສຸດທີ່ໃຫຍ່ກວ່າເລັກນ້ອຍຫຼັງຈາກຈຸດສູງສຸດຂອງຊ່ວງເປົ້າinາຍໃນການກວດພົບ Agilent 2100 Bioanalyzer, ຫຼືຄວາມເຂັ້ມຂຸ້ນຂອງ Qubit ທີ່ກວດພົບຕໍ່າກວ່າ qPCR. ການຂະຫຍາຍສຽງເລັກນ້ອຍເປັນປະກົດການປົກກະຕິ, ເຊິ່ງບໍ່ມີຜົນຕໍ່ການຈັດລໍາດັບຫ້ອງສະandຸດແລະການວິເຄາະຂໍ້ມູນໃນພາຍຫຼັງ.

    7. ຮວງປະກົດຢູ່ໃນໂປຣໄຟລ detection ການກວດພົບຂອງ Agilent 2100 Bioanalyzer

    ລັກສະນະຂອງຮວງໃນ Agilent 2100 Bioanalyzer ກວດຫາແມ່ນເນື່ອງມາຈາກການແຍກຕົວຢ່າງທີ່ບໍ່ສະໍ່າສະເ,ີ, ບ່ອນທີ່ຈະມີຊິ້ນສ່ວນຫຼາຍຂຶ້ນຢູ່ໃນຂະ ໜາດ ທີ່ແນ່ນອນ, ແລະອັນນີ້ຈະກາຍເປັນທີ່ຈະແຈ້ງຫຼາຍຂຶ້ນຫຼັງຈາກການເສີມ PCR. ໃນກໍລະນີນີ້, ມັນຖືກແນະນໍາໃຫ້ບໍ່ດໍາເນີນການເລືອກຂະ ໜາດ, ieາຍຄວາມວ່າຕັ້ງເງື່ອນໄຂການແບ່ງສ່ວນໃຫ້ເປັນ 94 ° C ເປັນເວລາ 15 ນາທີ, ບ່ອນທີ່ການແຜ່ກະຈາຍຂອງຊິ້ນສ່ວນມີຂະ ໜາດ ນ້ອຍແລະເຂັ້ມຂຸ້ນ, ແລະສາມາດປັບປຸງຄວາມເປັນເອກະພາບກັນໄດ້.

    ຂຽນຂໍ້ຄວາມຂອງເຈົ້າຢູ່ທີ່ນີ້ແລະສົ່ງໃຫ້ພວກເຮົາ